Những năm qua, mối quan hệ phối hợp công tác giữa Kiểm toán nhà nước thông qua Kiểm toán nhà nước khu vực III với các địa phương đạt được hiệu quả tốt.
Công tác phối hợp với Kiểm toán Nhà nước giúp các địa phương kịp thời khắc phục những bất cập, thiếu sót khi ban hành các nghị quyết phân bổ, cân đối ngân sách.